IRA口座で、W8-BENは適用になりますか？

なります。

水鉄砲さんと同じようにアメリカでIRA口座を保持しています。現在は日本在住で、GCや市民権は持っていません。
日本に引越した際に、その金融機関に（IRA口座以外にmutual fundも持っています）日本の住所にネット上で変更したところ、２週間後くらいに日本の住所にW8-BENが郵送で届きました。
その説明書の中に、IRAを持っている人は特にXXの欄は記入必須ですというようなことが書かれてありました。
ですから「適用になる」ということだと思います。

書き忘れましたが、今年２０１４年の話です。

海中の電灯さん、早速のご回答有難うございました。

日本での確定申告になると、日本での総収入に合算されてしまいますので、税金の支払いが増えそうですね。1042NRですと、取り敢えず3500ドルが控除されるので、少しましかなと思えたのですが、これを念頭に入れて取り崩しをしたいと思います。

有難うございました。