口座内での買い替え

RothIRAの分はファンドを買い換えるのであれば税金は掛かりません。

課税口座の場合はCapital Gainがあれば、その分は課税されます。ただし、原価（Cost Basis)にご注意ください。今までいくらかの配当があったと思うのですが、その分を再投資（Reinvestment）していた場合は、その分を原価に足して申告する必要があります。ご注意ください。

「売ってからsp500を買うことになりますか？」とのことですが、Vanguardであれば、そのままターゲットファンド-->S&P500となります（売ると買うが同時ということになります）。

会計士に依頼しているのであれば、ファンドを売った場合に発行されるForm 1099-Bを提出すれば問題ないかと思います。そのフォームに原価は書いてあるのですが、ファンドを購入したのがある年以前のものは（すいません、何年だったか失念しました）、Noncovered と言ってその金額がVanguardからIRSにはレポートされません。それでもVanguardの場合は向こうが計算した原価が載っているので、それを使うだけで通常は良いはずです。載っていない場合（はないと思いますが）は過去の取引の記録から自分で計算する必要があると思います（会計士がやってくれるとは思いますが）。

自分でソフトを使って申告する場合は、何を入力するべきか理解していないと間違った申告になることがあります。VanguardなのでForm 1099-Bだけでいいはずなのですが、念の為と思って書かせていただきました。