カリフォルニア州税の確定申告について

早速のたくさんのコメントありがとうございます！
大学でのTax workshopには参加しました。そこで教えてもらった大学の推奨するサイト(Glacier)でFederal tax returnは作成できました（まだ送っていません）。でも私の回答のとおりだと勝手に1041NR-EZが作成されてしまうので（やり直してみましたがやはり1040NR-EZしかできない）540NR long formのline番号の指示記載が一致せず、わけがわかりません。
workshopの内容はやはり一般的な留学生を対象にした話だったので、私のようなsituationでの話は出ませんでした。workshopの途中では質問はたくさん出て（個人ごとに状況が違うため）結局個別に聞きに行った方がいい感じがしました。でもそのワークショップの場では私は話について行けず、質問できませんでした。同じ大学の日本人の友人たちに聞いてみたのですが、みんなW-2をもらっているのでわからないと言われ、メールで大学のTax cordinatorに聞いてみても”私はコンサルタントではないから答えられない”と言われ、the Franchise Tax Board hotlineに聞いてくれと言われました。私のリスニング力と税金の専門用語など、書類を見ているだけでもチンプンカンプンなので、電話するのを躊躇しています。結局わからないのではないかと。メールや文書だったら辞書を引き引き、なんとかできるかなと思っているのですが。それかカリフォルニア州税のweb siteをくまなく読むか。。。
それでいろいろネットで検索していたところ、このサイトを見つけ、投稿した次第です。どなたか私の様なsituationや経験をされた方がいるかな、と思いました。
税理士さんに相談するのも、なんか本末転倒のような、、、税金を少なく払うためだとはいえ（おそらくJ-1の最初の2年間はほとんど税金を払わなくてよいと聞いたので）、税理士さんに多額のお金を払うのは。ちなみに税理士さんっていくらかかるものなのでしょうか？相談だけとか書類作成までとか、いろいろ金額があるのでしょうか。とにかくお金がないので、税金も不必要には払いたくないし、そのためにはなるべく自分でできることは自分でやりたいです。
まだ書類提出期限までに時間があるので、もっと勉強してからhotlineに電話するなりした方がいいですね。
Kayさん、F Friesさん、迅速に親切に回答してくださりありがとうございました。

早速のお返事ありがとうございます。
すみません、CPAってなんですか？？？
そういうことからしてわからない状態なので、相談なんてとても恐ろしくてできないと思っています。
相談に行って（または電話でも）いろいろ知らない単語をたくさん使われるかと思うと、パニッックになります。

一応CA州のCPA（ライセンス持ち）ですが、私も私の周囲もTaxとは全く関係ない仕事（企業の内部監査）をしているので、CPAだからと言ってTax returnに詳しいわけではありません。。。

私は去年、子供がお世話になっていたホーム・デイケアにIRSの査察が入り、びっくりしてこちらの掲示板で相談させていただきました。今までIRSに関係するなんてことがなかったので（毎年のTax Return以外に）噂に聞くIRSの恐ろしさ、『泣く子も黙るIRS（！？）』という現実を目の辺りにして、Kayさんも書かれていますが、『Taxに関してはケチるべからず』というのはアメリカに住む以上鉄則だと思います。

IRSにしてもCA州政府にしても税収が落ち込んでいるので、チェックは厳しいはずです。私が見たのはCA州政府ではなく、IRS（連邦政府）ですが、債務者（ホーム・デイケアを利用している私）に差押書が送られてきて、債務（デイケア費）を債権者（この場合はホーム・デイケア）に支払わずIRSに支払う事、それに従わない場合は連邦刑務所に送られる可能性があること、税金滞納者（ホーム・デイケア）の給与・財産差押、税金滞納にかかる利子（高額、年利20％程度でした）、罰金・罰則など、かなり恐ろしい事がかかれて有りました。

大学近くのH&R Blockなら、J1などに明るい人がいるはずです。H&R Blockのサイトに行けば、その人の専門が載っていて予約できます。

たくさんのコメントありがとうございます。とても勉強になります。IRSの査察は恐いんですね。知りませんでした。
本当に無知で、H&R Blockもネットで調べてようやく少しわかってきました。アメリカでは有名な会社なんですね。でも私のまわりでその会社を使ってTax returnをやったという話を聞きません。（まだ渡米して日が浅いからでしょうか）
J-1のことに詳しいかどうかもH&R Blockのサイトでは検索できませんでした。Non-US citizen とIncome earned outsite the USが専門という条件で絞って検索したところ、たくさんの経理士さん（？）が出て来て、誰を選んだらいいのか。J-1に明るい人でなければ意味が無いのですよね？相談料も外国人向けの相談（1040NRとか"Non-Resident"の書類作成）は値段がサイトには出ていなく、要相談らしいです。やっぱりISSOにまずどこに行ったらいいか聞いた方がいいでしょうか。

州によって違うかもしれないので、この質問は答えられる方がいないかもしれませんが、カリフォルニア州のState tax returnは、アメリカに住み始めてからだけでなく、2011年の日本に住んでいた時期に得た収入（給与）も申告しなければならないのでしょうか？でもそれを証明する書類がないですが、自己申告の金額で記入していいのでしょうか？アメリカに住み始めてからも私の場合は日本から支給される給与で生活しているわけですが、それも金額の証明書がありませんが、自己申告ということでいいのでしょうか？月給が日本にいたときとアメリカに来てからが随分と違うし（激減した）、もし州税を取られるとしたら税率も違うのではないかと思うので（１ヶ月分の給与 X 12ヶ月）という計算はできないと思ったのですが。

現在はお金がないと上記で書きましたが、Kayさんのおっしゃることの９割は渡米後すぐから実践中のつもりです（コーヒー持参1杯のみ、さらにランチは食べない、英会話レッスンは高いのでなるべくラボメンバーに食事に誘われたら（あまり誘われないが）断らず英会話の練習にする、外食で残ったらできるだけテイクアウトでもって帰る、光熱費節約のため暖房はつけない、冷房は元からない、でも家賃高い）。それでもアメリカに２年で帰る予定ではないので、この先続くかどうか。できれば来年は少しはボスから援助してもらえるよう、ボスの信用を得るべく、今はただひたすらデータを出すことにがんばっています。（ボスから給与が少しでも出ればW-2がもらえる訳ですよね。書類に悩まなくてすむ）でもKayさんのブログにもあるように、餅は餅屋につかせるほうがいいのは理解できます。私はアメリカで新しいことをやりたくて今の研究室を選んだのですが、結局私の今までの専門の方がやっぱり実験は得意なので、ラボメンバーから頼まれたり、データを出すのも得意な実験での方が早そうですし。。。アメリカ人は人を使うのがうまいな、と最近思いました。このTax returnにしてもH&R Blockを低所得者の人がよく使っているとは、わからないことに頭を使うよりも効率的に仕事をこなして（片付けて）、人生の時間を自分の楽しめることに使うのがうまい人種なんでしょうか。生粋の日本人の私にとってはとても新鮮です。
すみません、脱線しました。

みな様、いろいろとアドバイスありがとうございます。大変参考になります。
とりあえず思いつく必要と思われる書類はすべて作成しておいた方がいいようですね。複雑なことはしたくなかったので、手間を惜しんで手を抜こうとしてましたが、日本の収入も包み隠さず書いた方がいいということですね。
同じキャンパスにW-2をもらっていない日本人を見つけましたので、その人と一緒にISSOに相談に行くことにします。また行き詰まりましたらご相談させてください。本当にありがとうございました。